กองทุนทดแทนผู้ประสบภัย เป็นทุนหมุนเวียนหนึ่งที่อยู่ภายใต้การประเมินผลของกรมบัญชีกลาง ซึ่งที่ผ่านมา กองทุนฯ ได้ขับเคลื่อนการดำเนินงานและบริหารกองทุนฯ ตามแผนยุทธศาสตร์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยมีการปรับปรุงการดำเนินงานให้มีการประยุกต์ใช้เทคโนโลยีและนวัตกรรมดิจิทัล เพื่อยกระดับคุณภาพการดำเนินงานทั้งภายในกองทุนฯ และการให้บริการแก่ผู้มีส่วนได้ ส่วนเสียภายนอก อีกทั้งได้มีกำกับการควบคุมภายในและการบริหารความเสี่ยง รวมถึงมีการติดตามระบบการบริหารจัดการที่สำคัญ ทั้งด้านการเงิน การดำเนินงานตามวัตถุประสงค์กองทุนฯ การบริหารความเสี่ยง การจัดการสารสนเทศ และการบริหารทรัพยากรบุคคล จากการดำเนินงานที่มีประสิทธิภาพดังกล่าว ส่งผลให้กองทุนฯ ได้รับคะแนนประเมินผลการดำเนินงานทุนหมุนเวียน ปี 2567 ประเภทการสงเคราะห์และสวัสดิการสังคม รวมในระดับสูงถึง 4.6654 คะแนน จากคะแนนเต็ม 5.0000 คะแนน ซึ่งเป็นคะแนนการประเมินสูงสุดที่กองทุนทดแทนผู้ประสบภัยเคยได้รับการประเมิน จากกรมบัญชีกลาง
